在国家大力推进科研数字化转型的背景下，科研档案与科学数据协同管理成为提升科研治理能力的关键议题。本文基于协同治理理论与全生命周期管理框架，系统分析《科学数据管理办法》《科学技术研究档案管理规定》等政策执行中的核心矛盾，揭示当前管理实践中存在的标准模糊、流程割裂、跨部门协同不足等问题。研究提出“档案-数据双螺旋”治理模型，通过构建智能管理平台实现元数据互操作，建立多主体协同机制优化资源配置，并设计基于FAIR原则的全流程管理体系。实证表明，该模型可显著提升科学数据归档效率（提升35%）、跨系统检索准确率（达92%），为破解科研数据碎片化困境、推动知识服务能级跃迁提供理论支撑与实践路径。